RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	AKAP10	O43572	662 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NME2P1	O60361	137 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	LRAT	O95237	230 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NME2	P22392	152 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SOX18	P35713	384 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SOX3	P41225	446 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PSPH	P78330	225 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ATCAY	Q86WG3	371 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	BCORP1	Q8N888	145 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	COQ9	O75208	318 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	OR6B1	O95007	311 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	G6PD	P11413	515 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	GPX3	P22352	226 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CLDN8	P56748	225 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NRG3	P56975	720 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PTGR1	Q14914	329 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	RTL4	Q6ZR62	310 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	FAR1	Q8WVX9	515 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ASPDH	A6ND91	283 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SDHD	O14521	159 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ACOX3	O15254	700 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	FBXO45	P0C2W1	286 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	KIT	P10721	976 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	EMD	P50402	254 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MLC1	Q15049	377 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF385B	Q569K4	471 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	GRHL3	Q8TE85	626 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	KAT2A	Q92830	837 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MAGEB18	Q96M61	343 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TRIM4	Q9C037	500 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MED4	Q9NPJ6	270 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	KLHL1	Q9NR64	748 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MAP10	Q9P2G4	905 aa		18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NAGA	P17050	411 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	DRD5	P21918	477 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PTGER1	P34995	402 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	PPIC	P45877	212 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	DUSP8	Q13202	625 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CPTP	Q5TA50	214 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	FHL5	Q5TD97	284 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	LYPD8	Q6UX82	237 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	OR2L13	Q8N349	312 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	OR7G2	Q8NG99	324 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	COQ8B	Q96D53	544 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TAAR6	Q96RI8	345 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ITPA	Q9BY32	194 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	HES7	Q9BYE0	225 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	VPS4A	Q9UN37	437 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		18.41	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TTC36	A6NLP5	189 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-208	ENST00000470965	TGDS	O95455	350 aa		18.4	■□□□□ 0.54

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