RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 MED27Q6P2C8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZVL8 140 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 SCRN2Q96FV2 425 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 NRTNQ99748 197 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ATF6BQ99941 703 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 BEX1Q9HBH7 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 GULP1Q9UBP9 304 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 AGAP14A8MT82 685 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGEF6Q15052 776 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 KRT74Q7RTS7 529 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 AP3S1Q92572 193 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 UFD1Q92890 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 A8MVJ9 347 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ANHXE9PGG2 379 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 SEC14L5O43304 696 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 PDGFAP04085 211 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 FAM157BP0CG42 384 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 MPC1LP0DKB6 136 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 MMP11P24347 488 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 PPP3R1P63098 170 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 LMAN2Q12907 356 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 NLNQ9BYT8 704 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 KCNK12Q9HB15 430 aa14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SFRP4-201ENST00000436072 USP34Q70CQ2 3546 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL18O94889 574 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LGI1O95970 557 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 NNMTP40261 264 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 GIPRP48546 466 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 EVX1P49640 407 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL22Q53GT1 634 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 IDNKQ5T6J7 187 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 BMPERQ8N8U9 685 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SPG21Q9NZD8 308 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 REV3LO60673 3130 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MYO10Q9HD67 2058 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SERTM1A2A2V5 107 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TGM5O43548 720 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 HCN1O60741 890 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ELK1P19419 428 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ETV3P41162 512 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 RAB33AQ14088 237 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 GPR176Q14439 515 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FGFBP1Q14512 234 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CHST14Q8NCH0 376 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 BEST4Q8NFU0 473 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MED28Q9H204 178 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 IL21Q9HBE4 155 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 KCND3Q9UK17 655 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.58□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 B8ZZF3 427 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms