RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 FNIP2Q9P278 1114 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NENFQ9UMX5 172 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CACNA1FO60840 1977 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 B3GALT2O43825 422 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ITGA5P08648 1049 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CAPZA1P52907 286 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NAGSQ8N159 534 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LURAP1Q96LR2 239 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RASD1Q9Y272 281 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 OARD1Q9Y530 152 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 H7C417 338 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZNF208O43345 1280 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PTHP01270 115 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 UBBP0CG47 229 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MMP12P39900 470 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 CD79BP40259 229 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 DLX5P56178 289 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MAP6Q96JE9 813 aa9.35□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 MYO10Q9HD67 2058 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 A0A0A6YYH2 397 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 A6NJ64 397 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RFXAPO00287 272 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 AGR2O95994 175 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HCKP08631 526 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 MAP4K2Q12851 820 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 CHST9Q7L1S5 443 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PDZD3Q86UT5 571 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NPWQ8N729 165 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 BBS10Q8TAM1 723 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LCN9Q8WX39 176 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HSPA12AO43301 675 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SLC34A2O95436 690 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 OR8U9P0C7N5 309 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 PPM1AP35813 382 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 PREPP48147 710 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-202ENST00000402738 RNF39Q9H2S5 420 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HRH4Q9H3N8 390 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 ANHXE9PGG2 379 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 LIPAP38571 399 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-202ENST00000402738 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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