RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 COLEC12Q5KU26 742 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CPTPQ5TA50 214 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINK14Q6IE38 97 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OGFOD2Q6N063 350 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEB18Q96M61 343 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WV62 115 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SDHDO14521 159 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 COQ9O75208 318 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NEURL1O76050 574 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RASAL1O95294 804 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TGDSO95455 350 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GPC1P35052 558 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MLLT10P55197 1068 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C21orf58P58505 322 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP2Q05923 314 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGR1Q14914 329 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RTL4Q6ZR62 310 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATCAYQ86WG3 371 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 BCORP1Q8N888 145 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KAT2AQ92830 837 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SCMH1Q96GD3 660 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PLOD2O00469 737 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOX3O15254 700 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6B1O95007 311 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CBX7O95931 251 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLPSP04118 112 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DRD5P21918 477 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GPX3P22352 226 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX3P41225 446 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS6KA2Q15349 733 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NXNQ6DKJ4 435 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 COQ8BQ96D53 544 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DPY30Q9C005 99 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL1Q9NR64 748 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 POLEQ07864 2286 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TP53I11O14683 189 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NME2P1O60361 137 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NAGAP17050 411 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NME2P22392 152 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHA3P29320 983 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGER1P34995 402 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PPICP45877 212 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 DIO3P55073 304 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPB3Q12988 150 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ESPL1Q14674 2120 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MLC1Q15049 377 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ACAD11Q709F0 780 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR7G2Q8NG99 324 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.22□□□□□ -0.13
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