RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 LRFN4Q6PJG9 635 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GPR26Q8NDV2 337 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR5T2Q8NGG2 359 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HOXD1Q9GZZ0 328 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GDE1Q9NZC3 331 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ISPDA4D126 451 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GRXCR2A6NFK2 248 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CCINQ13939 588 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CASTOR1Q8WTX7 329 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PEX11GQ96HA9 241 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR1F2PQ96R84 312 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MTG2Q9H4K7 406 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VNN3Q9NY84 501 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL42Q9P2K6 505 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC13A5PLN9 417 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VSTM2BA6NLU5 285 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MTNR1AP48039 350 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NSDHLQ15738 373 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T4Q8NH00 348 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 POTEKPQ9BYX7 375 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RXFP3Q9NSD7 469 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ST14Q9Y5Y6 855 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ITGB7P26010 798 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RBMXP38159 391 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GPR4P46093 362 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 RGNQ15493 299 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 C22orf42Q6IC83 251 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC1Q9NVT9 282 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0513O60268 411 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 UGT8Q16880 541 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS12Q86WS5 348 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A8Q8N695 610 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DENND6BQ8NEG7 585 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 OR5AR1Q8NGP9 310 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MAL2Q969L2 176 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BEX2Q9BXY8 128 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BEX1Q9HBH7 125 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GVC2 190 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LCN1P31025 176 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SOX9P48436 509 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VEZF1Q14119 521 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GTDC1Q4AE62 458 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM69Q5SWH9 247 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD9Q7L273 389 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KLBQ86Z14 1044 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SMURF1Q9HCE7 757 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 USP3Q9Y6I4 520 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 IRS2Q9Y4H2 1338 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CA3P07451 260 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HTR3DQ70Z44 454 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HPF1Q9NWY4 346 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A11Q9UPY5 501 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV6A0A075B6T7 132 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 HSD11B2P80365 405 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 DOK4Q8TEW6 326 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BORCS8Q96FH0 119 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 BTNL2Q9UIR0 455 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN4O14817 238 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LATO43561 262 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 VNN2O95498 520 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 MYF6P23409 242 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF584Q8IVC4 421 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA1Q8N8W4 532 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-203ENST00000366687 LRRTM2O43300 516 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PROS1P07225 676 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ACVR1BP36896 505 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 NAGSQ8N159 534 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N402 240 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 KATNBL1Q9H079 304 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TREX1Q9NSU2 369 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GSTM2P28161 218 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K3P46734 347 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CAPZA1P52907 286 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 INHBCP55103 352 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DEFA5Q01523 94 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 SERTAD2Q14140 314 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DTWD1Q8N5C7 304 aa19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms