RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 HSDL2Q6YN16 418 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MORN4Q8NDC4 146 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM203Q969S6 136 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD7Q96MP8 289 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0G2JN53 185 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 STK25O00506 426 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 RGS13O14921 159 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC6A11P48066 632 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 XKRXQ6PP77 449 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 BBS4Q96RK4 519 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1W2PQ09 198 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FABP12A6NFH5 140 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9A3P48764 834 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CSNK1G2P78368 415 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PLK5Q496M5 336 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GPA33Q99795 319 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DEC1Q9P2X7 70 aa20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PRODHO43272 600 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PCCBP05166 539 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MSL3P1P0C860 447 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ACP2P11117 423 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 IFNGR2P38484 337 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM163Q8TC26 289 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FGF11Q92914 225 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MED18Q9BUE0 208 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC22A4Q9H015 551 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 RERGLQ9H628 205 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0G2JPF8 293 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM129A0AVI4 362 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CLCNKAP51800 687 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TAS2R38P59533 333 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CDK3Q00526 305 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 DDI2Q5TDH0 399 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM64Q6YI46 380 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TTLQ8NG68 377 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 RNFT2Q96EX2 444 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX18Q96RF0 628 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM245Q9H330 911 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LRIT2A6NDA9 550 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC30A4O14863 429 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 EPPINO95925 133 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CHRM4P08173 479 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 P2RY2P41231 377 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 ASAH1Q13510 395 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC9A5Q14940 896 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 AP3S1Q92572 193 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB7BQ96AH8 199 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PHOX2BQ99453 314 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LGR4Q9BXB1 951 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms