RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 COL4A3Q01955 1670 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 WWP2O00308 870 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 STK25O00506 426 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MYL12AP19105 171 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NTSP30990 170 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 BHLHB9Q6PI77 547 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 IQCHQ86VS3 1027 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 TTLQ8NG68 377 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SUN3Q8TAQ9 357 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SFXN5Q8TD22 340 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NELL2Q99435 816 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 HDAC8Q9BY41 377 aa26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SNTNA6NMZ2 147 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SLC35G4P0C7Q5 338 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MYOGP15173 224 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SSR2P43308 183 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CSNK1G2P78368 415 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CDK3Q00526 305 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 TMEM35AQ53FP2 167 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ISYNA1Q9NPH2 558 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 DEC1Q9P2X7 70 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 A8MU76 341 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CDRT1O95170 752 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 EPHX1P07099 455 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ETV5P41161 510 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ETV1P50549 477 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 WNT4P56705 351 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ZNF234Q14588 700 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ACSM5Q6NUN0 579 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 OR6F1Q8NGZ6 308 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 TMEM245Q9H330 911 aa26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 TMEM129A0AVI4 362 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NR2F6P10588 404 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 IL7P13232 177 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 P2RY2P41231 377 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NR4A2P43354 598 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A11P48066 632 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.821e-9■■□□□ 13.9
UBP1-201ENST00000283628 RAB40BQ12829 278 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 DUSP6Q16828 381 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 RAB43Q86YS6 212 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 OR6T1Q8NGN1 323 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 CREB3L4Q8TEY5 395 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 NR4A3Q92570 626 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 UCN3Q969E3 161 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 MED18Q9BUE0 208 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 KCNK12Q9HB15 430 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 FBXW2Q9UKT8 454 aa26.39■■□□□ 1.82
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JPF8 293 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 RGS13O14921 159 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 CYP7B1O75881 506 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 ACP2P11117 423 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R38P59533 333 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 AMER3Q8N944 861 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 BBS4Q96RK4 519 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 PINK1Q9BXM7 581 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 TM7SF3Q9NS93 570 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 LRIT2A6NDA9 550 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 MAN2B1O00754 1011 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 PRODHO43272 600 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 EPPINO95925 133 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN19P0C672 248 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 S100A1P23297 94 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 RFX2P48378 723 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 SCN1BQ07699 218 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.813e-7■■■□□ 17.5
UBP1-201ENST00000283628 SNAPC1Q16533 368 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 BAK1Q16611 211 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 PLK5Q496M5 336 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 SLC36A4Q6YBV0 504 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 HSDL2Q6YN16 418 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 TMEM163Q8TC26 289 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.38■■□□□ 1.81
UBP1-201ENST00000283628 C17orf62Q9BQA9 187 aa26.38■■□□□ 1.81
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