RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CYB5AP00167 134 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 EPCAMP16422 314 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HSD11B1P28845 292 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SPATC1Q76KD6 591 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM17Q86X19 198 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OR2L3Q8NG85 312 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 BADQ92934 168 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ACTRT3Q9BYD9 372 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 USP54Q70EL1 1684 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 M0R3H8 397 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PLD2O14939 933 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF432O94892 652 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KLKB1P03952 638 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ALPLP05186 524 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NR2C1P13056 603 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 UGT8Q16880 541 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NRMQ8IXM6 262 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GATSQ8NAP1 163 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF583Q96ND8 569 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FZD3Q9NPG1 666 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ANTXRLA6NF34 631 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 H3BSH0 61 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NNATQ16517 81 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PDZD3Q86UT5 571 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DOK4Q8TEW6 326 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 HCRTR2O43614 444 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GABBR2O75899 941 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TM4SF4P48230 202 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf61Q13536 156 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ELOCQ15369 112 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PNCKQ6P2M8 343 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SGTBQ96EQ0 304 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 BEX2Q9BXY8 128 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ABCG5Q9H222 651 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 BEX1Q9HBH7 125 aa16.73■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 NPC1O15118 1278 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PRLP01236 227 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ITGAMP11215 1152 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 IL1RNP18510 177 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CWH43Q9H720 699 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CD8B2A6NJW9 211 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C9J4A7 227 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 CD8BP10966 210 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TACR1P25103 407 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC5A2P31639 672 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ACVR1BP36896 505 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC6A9P48067 706 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PELI3Q8N2H9 469 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PTTG1O95997 202 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 C6orf183Q5T699 404 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SPRED1Q7Z699 444 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 LAMB1P07942 1786 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FUOMA2VDF0 154 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARNTP27540 789 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 PDHA2P29803 388 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB103AP81534 67 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 POU4F2Q12837 409 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 FAM26DQ5JW98 314 aa16.72■□□□□ 0.27
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms