RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox5bP19536 128 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcb1aP21447 1276 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Unc5dQ8K1S2 956 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BroxQ8K2Q7 411 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ahi1Q8K3E5 1047 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp991Q8R1N3 573 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp15Q8R4V2 235 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx11Q91WL6 271 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cela1Q91X79 266 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema6cQ9WTM3 931 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa8.74□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crybg1A0A0G2JG52 2065 aa8.74□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EpxP49290 716 aa8.73□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r7P59530 312 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab8bP61028 207 aa8.73□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rgs14P97492 547 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nme2Q01768 152 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q3U4G0 281 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccser2Q3UHI0 833 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acsm3Q3UNX5 580 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MagixQ4KL35 324 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Magee2Q52KG3 523 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd13bQ5F259 626 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrm3Q5ND52 418 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q5SPV6 233 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defa17Q64016 82 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tvp23aQ6NVH0 222 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HhipQ7TN16 700 aa8.73□□□□□ -1.01
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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