RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ldoc1Q7TPY9 151 aa20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mcfd2Q8K5B2 145 aa20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tex13bQ99MW5 186 aa20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Natd1Q9DBW3 110 aa20.75■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm14295A2BG91 834 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqca1lA6H690 825 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MbpP04370 250 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 VipP32648 170 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxo40P62932 710 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nr4a2Q06219 598 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpr165Q3V3A3 455 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SprnQ8BWU1 147 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ScgnQ91WD9 276 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Med27Q9DB40 311 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Syt11Q9R0N3 430 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr59B1ARL3 323 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm20671F6TVX7 576 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wsb2O54929 404 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtnd2P03893 345 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Limk1P53668 647 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 VaspP70460 375 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Defb23Q30KP0 166 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bpifb1Q61114 474 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bcap31Q61335 245 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd3eapQ76KJ5 399 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pgr15lQ80T54 456 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 F12Q80YC5 597 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb42Q811H0 420 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tgif2Q8C0Y1 237 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hcar1Q8C131 343 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhn1Q8C886 359 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr689Q8VG18 320 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr166Q8VGX2 312 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Necab3Q9D6J4 353 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Izumo2Q9DA16 220 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Isoc2bQ9DCC7 210 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr44Q9EQB8 314 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nek6Q9ES70 313 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Akr1a1Q9JII6 325 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acot2Q9QYR9 453 aa20.74■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap77A0A087WRI3 283 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm597E9Q8J5 896 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TstP52196 297 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamts19P59509 1210 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gal3st3P61315 431 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prss57Q14B24 284 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acss3Q14DH7 682 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pde12Q3TIU4 608 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 St8sia4Q64692 359 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cst13Q80ZN5 141 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr700Q8VFM5 316 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf144aQ925F3 292 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcg5Q99PE8 652 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Khdrbs2Q9WU01 349 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Esp18A8R0V1 91 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pgbd5D3YZI9 523 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smim18J3QNP2 93 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgf1P61148 155 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr5P61965 334 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PapolgQ6PCL9 739 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zc3hc1Q80YV2 501 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam161aQ8QZV6 448 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem45bQ8VCZ2 278 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr353Q8VGK0 311 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr380Q8VGT3 311 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dusp7Q91Z46 422 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem159Q922Z1 161 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Asf1aQ9CQE6 204 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc9bQ9D6E4 239 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam96aQ9DCL2 160 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ntn4Q9JI33 628 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Insm2Q9JMC2 493 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Orc6Q9WUJ8 262 aa20.73■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rex2A2AWF2 685 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 EllO08856 602 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 KeraO35367 351 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PgfP49764 158 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GlaP51569 419 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C1qaP98086 245 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bcl2a1cQ0P538 128 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MocosQ14CH1 862 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GkQ64516 559 aa20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 VclQ64727 1066 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Crb2Q80YA8 1282 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms