Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Mcfd2Q8K5B2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Mcfd2Q8K5B2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Mcfd2Q8K5B2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Mcfd2Q8K5B2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Mcfd2Q8K5B2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Mcfd2Q8K5B2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Mcfd2Q8K5B2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Mcfd2Q8K5B2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Mcfd2Q8K5B2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Mcfd2Q8K5B2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Mcfd2Q8K5B2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Mcfd2Q8K5B2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Mcfd2Q8K5B2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mcfd2Q8K5B2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Mcfd2Q8K5B2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Mcfd2Q8K5B2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mcfd2Q8K5B2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Mcfd2Q8K5B2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Mcfd2Q8K5B2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Mcfd2Q8K5B2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Mcfd2Q8K5B2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Mcfd2Q8K5B2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Mcfd2Q8K5B2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Mcfd2Q8K5B2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Mcfd2Q8K5B2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Mcfd2Q8K5B2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Mcfd2Q8K5B2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Mcfd2Q8K5B2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Mcfd2Q8K5B2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Mcfd2Q8K5B2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Mcfd2Q8K5B2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Mcfd2Q8K5B2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Mcfd2Q8K5B2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Mcfd2Q8K5B2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Mcfd2Q8K5B2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Mcfd2Q8K5B2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Mcfd2Q8K5B2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Mcfd2Q8K5B2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Mcfd2Q8K5B2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Mcfd2Q8K5B2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Mcfd2Q8K5B2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Mcfd2Q8K5B2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Mcfd2Q8K5B2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Mcfd2Q8K5B2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Mcfd2Q8K5B2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Mcfd2Q8K5B2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Mcfd2Q8K5B2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Mcfd2Q8K5B2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Mcfd2Q8K5B2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Mcfd2Q8K5B2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Mcfd2Q8K5B2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Mcfd2Q8K5B2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Mcfd2Q8K5B2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Mcfd2Q8K5B2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Mcfd2Q8K5B2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Mcfd2Q8K5B2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Mcfd2Q8K5B2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Mcfd2Q8K5B2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Mcfd2Q8K5B2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Mcfd2Q8K5B2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Mcfd2Q8K5B2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Mcfd2Q8K5B2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Mcfd2Q8K5B2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Mcfd2Q8K5B2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Mcfd2Q8K5B2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Mcfd2Q8K5B2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Mcfd2Q8K5B2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Mcfd2Q8K5B2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Mcfd2Q8K5B2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Mcfd2Q8K5B2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Mcfd2Q8K5B2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Mcfd2Q8K5B2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Mcfd2Q8K5B2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Mcfd2Q8K5B2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Mcfd2Q8K5B2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Mcfd2Q8K5B2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Mcfd2Q8K5B2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Mcfd2Q8K5B2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Mcfd2Q8K5B2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Mcfd2Q8K5B2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Mcfd2Q8K5B2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Mcfd2Q8K5B2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Mcfd2Q8K5B2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Mcfd2Q8K5B2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Mcfd2Q8K5B2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Mcfd2Q8K5B2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Mcfd2Q8K5B2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Mcfd2Q8K5B2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms