RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 SPIN4Q56A73 249 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 EMC4Q5J8M3 183 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TBCELQ5QJ74 424 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TMEM251Q8N6I4 163 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ERP27Q96DN0 273 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ACPTQ9BZG2 426 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 OR10A5Q9H207 317 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 OXSMQ9NWU1 459 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CFL2Q9Y281 166 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CAPN14A8MX76 684 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 PRSS44E7EML9 344 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NPIPB8E9PQR5 432 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 BCKDKO14874 412 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HCN1O60741 890 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NUDT17P0C025 328 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 MYL2P10916 166 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CHN1P15882 459 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 DEKP35659 375 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 DNASE1L1P49184 302 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 RAE1P78406 368 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 PLGLB1Q02325 96 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SLC10A1Q14973 349 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 FRMD7Q6ZUT3 714 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TRILQ7L0X0 811 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HOMEZQ8IX15 550 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ACBD4Q8NC06 268 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ZNF675Q8TD23 568 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HBEGFQ99075 208 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 RUBCNLQ9H714 662 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 MKS1Q9NXB0 559 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TAS2R7Q9NYW3 318 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 EHD3Q9NZN3 535 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HEY2Q9UBP5 337 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 AQP7O14520 342 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TP53I11O14683 189 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 ZNHIT1O43257 154 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SNX4O95219 450 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CLDN14O95500 239 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CPA3P15088 417 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 KRT15P19012 456 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 KRT4P19013 534 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 GPX3P22352 226 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HTR1EP28566 365 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 PIGAP37287 484 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 MAGEA5P43359 124 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SLCO1A2P46721 670 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HTR6P50406 440 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NAGLUP54802 743 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 NRG3P56975 720 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 DCAF7P61962 342 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 RPS6KA2Q15349 733 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 GXYLT1Q4G148 440 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 CD163Q86VB7 1156 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 MMP21Q8N119 569 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 OR10G3Q8NGC4 313 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 DOK4Q8TEW6 326 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CS-223ENST00000551137 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms