RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LMLN	Q96KR4	655 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AGPAT1	Q99943	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GAN	Q9H2C0	597 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HYPK	Q9NX55	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1A2	Q9Y585	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GUV1	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL11	O14625	94 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GRID2	O43424	1007 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LRCH4	O75427	683 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC24A	O95486	1093 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CALCA	P01258	141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	EDN1	P05305	212 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PROS1	P07225	676 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FOSL2	P15408	326 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AMD1	P17707	334 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GPX3	P22352	226 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN4	P29074	926 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR3A2	P47893	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CCR4	P51679	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ARFIP1	P53367	373 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SST	P61278	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ELP6	Q0PNE2	266 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SCGB2A2	Q13296	93 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIL2	Q13356	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PDIA5	Q14554	519 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CARTPT	Q16568	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	USP43	Q70EL4	1123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR49	Q8IV35	697 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	STPG4	Q8N801	248 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TM9SF4	Q92544	642 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	P3H4	Q92791	437 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS39	Q96JC1	886 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LURAP1	Q96LR2	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	S1PR3	Q99500	378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MARCH7	Q9H992	704 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MED23	Q9ULK4	1368 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ALPK3	Q96L96	1907 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ANHX	E9PGG2	379 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LMO7DN	F2Z398	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PDHX	O00330	501 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF11	O14901	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CHAD	O15335	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNGR4	O95473	234 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYAA	P02489	173 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	VTN	P04004	478 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINF2	P08697	491 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTA2	P09210	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXB7	P09629	217 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TPBGL	P0DKB5	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GNS	P15586	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CTNNA2	P26232	953 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX3	P41225	446 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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