RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TMUB2Q71RG4 321 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ITIH5Q86UX2 942 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ZSCAN30Q86W11 494 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CDHR1Q96JP9 859 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 NACA2Q9H009 215 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 LIME1Q9H400 295 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HPS4Q9NQG7 708 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SPASTQ9UBP0 616 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SPATA2Q9UM82 520 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 A0A0U1RRA0 63 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GTH9 108 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 LRP3O75074 770 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HPP00738 406 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 MT-ND1P03886 318 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 PROS1P07225 676 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HCKP08631 526 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FCARP24071 287 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TKTL1P51854 596 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CDKL1Q00532 357 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 IL1RL1Q01638 556 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 NEK5Q6P3R8 708 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 REG3GQ6UW15 175 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ASRGL1Q7L266 308 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FGFRL1Q8N441 504 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM186Q96B77 213 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 KRT23Q9C075 422 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SIRPDQ9H106 197 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf21Q9H246 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 NT5DC2Q9H857 520 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CPQQ9Y646 472 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 GAPVD1Q14C86 1478 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HECW2Q9P2P5 1572 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM89A2RUT3 159 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SH2D1BO14796 132 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA4FO95754 770 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 RENP00797 406 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 APRTP07741 180 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 OR9G9P0C7N8 305 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 BCL3P20749 454 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ACP1P24666 158 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 RABIFP47224 123 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CCL11P51671 97 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 GAMTQ14353 236 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 EMC2Q15006 297 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 LEMD1Q68G75 181 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 KDM8Q8N371 416 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 RDH11Q8TC12 318 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 PHYHIPQ92561 330 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 DEFB118Q96PH6 123 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 DCTPP1Q9H773 170 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 TOPBP1Q92547 1522 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 WDR97A6NE52 1622 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 KDM6BO15054 1643 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 ABCC8Q09428 1581 aa3.46□□□□□ -1.85
PTPRK-215ENST00000498284 WIZO95785 1651 aa3.46□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms