RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PLIN2	Q99541	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NFASC	O94856	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	COL4A1	P02462	1669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ASTN1	O14525	1302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KLF11	O14901	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TM9SF1	O15321	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SLC37A4	O43826	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NMT2	O60551	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC22	O60826	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SMIM24	O75264	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CRCP	O75575	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SHBG	P04278	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	EDN1	P05305	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MMP10	P09238	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AMD1	P17707	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GYG1	P46976	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	IRX4	P78413	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	XIAP	P98170	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	MYL7	Q01449	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	P2RY6	Q15077	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PPA1	Q15181	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CD101	Q93033	1021 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	VEGFD	O43915	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	TDP2	O95551	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	TAC1	P20366	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	ANOS1	P23352	680 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	SFTPD	P35247	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	PEX19	P40855	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	IFNAR2	P48551	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	CLCN4	P51793	760 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	CDH11	P55287	796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	UCP2	P55851	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-227	ENST00000470563	CLDN17	P56750	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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