RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 SETD6Q8TBK2 473 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ARRDC3Q96B67 414 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FEZF1A0PJY2 475 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PRRT4C9JH25 899 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TPST2O60704 377 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 UGT2B17O75795 530 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SEMA3DO95025 777 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR12D1P0DN82 309 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 HTR3AP46098 478 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 BAK1Q16611 211 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OCLNQ16625 522 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PHC2Q8IXK0 858 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 NACC2Q96BF6 587 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RHBGQ9H310 441 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF221Q9UK13 617 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 HCN2Q9UL51 889 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 REV3LO60673 3130 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PRKYO43930 277 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TBX19O60806 448 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PRNPP04156 253 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RB1P06400 928 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PSPHP78330 225 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FUZQ9BT04 418 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR34Q9UPC5 381 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ANTXRLA6NF34 631 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 M0R3H8 397 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 AP3D1O14617 1153 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 CDRT1O95170 752 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF79Q15937 498 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 USP30Q70CQ3 517 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 UCN3Q969E3 161 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TIGARQ9NQ88 270 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 CMAHPQ9Y471 501 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ITGB7P26010 798 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RFX2P48378 723 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR50Q13585 617 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RNLSQ5VYX0 342 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PDZD3Q86UT5 571 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 COMTD1Q86VU5 262 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SUN5Q8TC36 379 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 OR51I1Q9H343 314 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RERGLQ9H628 205 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 WDR70Q9NW82 654 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PLD2O14939 933 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TMPRSS11DO60235 418 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PSMB5P28074 263 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 GINS1Q14691 196 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 WDFY2Q96P53 400 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 QRFPRQ96P65 431 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 SRRQ9GZT4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 PELI2Q9HAT8 420 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 LHX9Q9NQ69 397 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN4-211ENST00000468468 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms