RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 CCDC166P0CW27 439 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 IRF2P14316 349 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MX1P20591 662 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ANXA13P27216 316 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 AXLP30530 894 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FDFT1P37268 417 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 AVPR1AP37288 418 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NAMPTP43490 491 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 HAAOP46952 286 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 VAMP7P51809 220 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 STK38Q15208 465 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SPHARQ15513 63 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SYPL1Q16563 259 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CDKN3Q16667 212 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DUSP6Q16828 381 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LRRC31Q6UY01 552 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 Q6ZTK2 550 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PIM3Q86V86 326 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 COMMD2Q86X83 199 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 COMMD1Q8N668 190 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NECAB1Q8N987 351 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SEMA4DQ92854 862 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 C7orf34Q96L11 122 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MARK4Q96L34 752 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 VPS35Q96QK1 796 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RHOJQ9H4E5 214 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FZD3Q9NPG1 666 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RNF146Q9NTX7 359 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 AHSPQ9NZD4 102 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TMCO1Q9UM00 188 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TIMM22Q9Y584 194 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CCDC144AA2RUR9 1427 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 A0A1W2PPE3 182 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MTMR11A4FU01 709 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 E9PQ18 207 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TEX46H3BTG2 121 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 I6L893 689 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 TIMM23O14925 209 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LDB2O43679 373 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZIC3O60481 467 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ECDO95905 644 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CHRNB2P17787 502 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CBLP22681 906 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LMO1P25800 156 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 LAP3P28838 519 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 HTR2BP41595 481 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ACADSBP45954 432 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GPR4P46093 362 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CASP4P49662 377 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 THOP1P52888 689 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 P2RX3P56373 397 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SELENOVP59797 346 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 GABPAQ06546 454 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SLC3A1Q07837 685 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 FOXM1Q08050 763 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 MYBPHQ13203 477 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 SLAQ13239 276 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 CHRNA6Q15825 494 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 PARP6Q2NL67 630 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF284Q2VY69 593 aa4.12□□□□□ -1.75
ATRX-204ENST00000460639 ZNF699Q32M78 642 aa4.12□□□□□ -1.75
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