RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CAPZBP47756 277 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 RAPSNQ13702 412 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 DPYSQ14117 519 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CHRNA6Q15825 494 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 LCN10Q6JVE6 187 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 IRGCQ6NXR0 463 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SYVN1Q86TM6 617 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 EXD1Q8NHP7 514 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 UCK1Q9HA47 277 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZFP57Q9NU63 452 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 VPS18Q9P253 973 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIAA1456Q9P272 454 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM63AO94886 807 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PYGLP06737 847 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS1P07477 247 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ETFAP13804 333 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF30P17039 623 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PSMA2P25787 234 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MIPP30301 263 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLCNKAP51800 687 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 FUT6P51993 359 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ERVK11-1P61568 191 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAMLD1Q13495 774 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 NFE4Q86UQ8 179 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SATL1Q86VE3 508 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZBTB2Q8N680 514 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MR1Q95460 341 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM63Q969Q1 353 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SH3GL2Q99962 352 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM7Q9C029 511 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR2AG1Q9H205 316 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CARD9Q9H257 536 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDE7BQ9NP56 450 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 NT5MQ9NPB1 228 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 C1RLQ9NZP8 487 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEMTQ9UBM1 199 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 RARRES3Q9UL19 164 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CHKBQ9Y259 395 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 NF1P21359 2839 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MTX2O75431 263 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SCRG1O75711 98 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TCF4P15884 667 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 IL4RP24394 825 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 CA5AP35218 305 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 HCAR3P49019 387 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPINT3P49223 89 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 MARC1Q5VT66 337 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ALS2CLQ60I27 953 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPAT4Q86UL3 456 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms