RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 COQ7Q99807 217 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ABCG4Q9H172 646 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK13Q9HB14 408 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 GDF3Q9NR23 364 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SPASTQ9UBP0 616 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PTPN23Q9H3S7 1636 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 UBE4BO95155 1302 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 A0A0U1RRA0 63 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GU03 582 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SSX5O60225 188 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TSPAN2O60636 221 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CSO75390 466 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MT-ATP6P00846 226 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FHP07954 510 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM49P0CI25 452 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM49CP0CI26 452 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KRT5P13647 590 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 AZU1P20160 251 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ASMTP46597 345 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CCL11P51671 97 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NFATC2Q13469 925 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 LY6DQ14210 128 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NECTIN1Q15223 517 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RTL6Q6ICC9 239 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZRG5 221 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CARM1Q86X55 608 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PARP8Q8N3A8 854 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF485Q8NCK3 441 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H2ACQ93077 130 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SYT11Q9BT88 431 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SIRPDQ9H106 197 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HOMER3Q9NSC5 361 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 THEGQ9P2T0 379 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2.56□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 METP08581 1390 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SOCS3O14543 225 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RASGRF2O14827 1237 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 DCXO43602 365 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 IDH3BO43837 385 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SNAP91O60641 907 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP5-8O75690 187 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ANXA9O76027 345 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SYNGR4O95473 234 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TGFAP01135 160 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 FCER2P06734 321 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CCNA2P20248 432 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RABIFP47224 123 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SLC17A1Q14916 467 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 P2RY14Q15391 338 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 C2CD6Q53TS8 623 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 OR6B2Q6IFH4 312 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 RDH11Q8TC12 318 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 CAPNS2Q96L46 248 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 SAMD8Q96LT4 415 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 TAAR6Q96RI8 345 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK16Q96T55 309 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 HPS4Q9NQG7 708 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 ERVK-18Q9QC07 812 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 PTCH1Q13635 1447 aa2.55□□□□□ -2
CCDC82-202ENST00000423339 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252.8 ms