RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 PRR5P85299 388 aa22.59■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 OLIG3Q7RTU3 272 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.59■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.59■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 MPIP34949 423 aa22.58■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 LIPAP38571 399 aa22.58■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.58■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 MYO9BQ13459 2157 aa22.58■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 RASGRP1O95267 797 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 SYT16Q17RD7 645 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 GPAT3Q53EU6 434 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 LINC00299Q6ZSB3 139 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 KCT2Q8NC54 265 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 NT5CQ8TCD5 201 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 ADORA3P0DMS8 318 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 MC3RP41968 323 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 ILKQ13418 452 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 ADCK1Q86TW2 530 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 SLC7A13Q8TCU3 470 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF675Q8TD23 568 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 LGALS12Q96DT0 336 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 VMP1Q96GC9 406 aa22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.57■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PRQ8 180 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.56■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.56■■□□□ 1.2
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TRIM54-201ENST00000296098 SOX14O95416 240 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF846Q147U1 533 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 KIR2DS3Q14952 304 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 Q6ZNX1 250 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM73Q86UV7 250 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.56■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 A6NCN8 305 aa22.55■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 CLDN25C9JDP6 229 aa22.55■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 TNFRSF10CO14798 259 aa22.55■■□□□ 1.2
TRIM54-201ENST00000296098 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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