RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24.91■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMDEC1O15204 470 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DYRK3O43781 588 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL3O75679 317 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 IDSP22304 550 aa24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC19A1P41440 591 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A12P48065 614 aa24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf34Q96L11 122 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 FRG2BQ96QU4 278 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF621Q6ZSS3 439 aa24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 AASSQ9UDR5 926 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 POFUT2Q9Y2G5 429 aa24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 COLEC12Q5KU26 742 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 ELMO1Q92556 727 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC13A2Q13183 592 aa24.87■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 ASMTP46597 345 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL7P80098 99 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RPE65Q16518 533 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAIN2Q5VXU1 208 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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