RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZfatQ7TS63 1237 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt7Q80VA0 657 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf222Q8CEF8 211 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sirt4Q8R216 333 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RabepkQ8VCH5 380 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr53Q8VGL8 312 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3mQ99JX4 374 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex19.2Q9D5S1 317 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nectin3Q9JLB9 549 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpk1Q9R0M5 243 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35a2Q9R0M8 390 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Loxl3Q9Z175 754 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1123A2AT85 323 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esp18A8R0V1 91 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14862B1AV28 81 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17615E9Q9P2 165 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4775F7ANJ3 135 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3248K7N721 186 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8897L7N294 181 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephb6O08644 1014 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxd2O35392 492 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wsb2O54929 404 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxq1O70220 400 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrg2P22723 474 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam1P31809 521 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lefty2P57785 368 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlanaQ2TA50 113 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klf4Q60793 483 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3aQ6P4P1 422 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nadsyn1Q711T7 725 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrg7Q8BM96 785 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8C3W1 322 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpne5Q8JZW4 593 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp15Q8R4V2 235 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q91V76 315 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam2Q925P2 520 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16286Q9CQX6 220 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prps2Q9CS42 318 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2fQ9CY34 185 aa12.02□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc7B1AX39 541 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 L3mbtl4B1B1A0 621 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20547B8JJN0 1276 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb9cI7HJI5 387 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa3O35639 323 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CfbP04186 761 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx4P70325 552 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs14P97492 547 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grhl3Q5FWH3 603 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClpbQ60649 677 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med22Q62276 200 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St8sia4Q64692 359 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsbn1Q80T69 795 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt12Q8BG71 446 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mblac2Q8BL86 279 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pp2d1Q8BVT6 620 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr158Q8C419 1200 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt13Q8CF93 556 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dleu7Q8CHZ8 209 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bag5Q8CI32 447 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr18Q8K1Z6 331 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints14Q8R3P6 515 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdt1Q8R4E9 557 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab28Q99KL7 221 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl7c1Q9CRB5 251 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Twist2Q9D030 160 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aar2Q9D2V5 384 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek6Q9ES70 313 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps29Q9QZ88 182 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcn11A2BHR2 178 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RerglB2RVE2 204 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl3E0CZ16 587 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm14E9Q3T6 561 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8922F6XVS9 199 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28048F7BCN0 99 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Suv39h1O54864 412 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk16O88697 305 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2a1Q07440 172 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msto1Q2YDW2 556 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Riiad1Q3KNY5 119 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxf3Q4ZGD9 553 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fut10Q5F2L2 481 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC061212Q6P8K3 481 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fblim1Q71FD7 375 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1344Q7TQV3 321 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr594Q7TRR4 311 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F12Q80YC5 597 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigzQ8BTP0 560 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl3Q8C4V4 428 aa12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms