RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	AGR3	Q8TD06	166 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TMCO6	Q96DC7	493 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL20	Q96IG2	436 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNH6	Q9H252	994 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ALG9	Q9H6U8	611 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL15	Q9NXU5	204 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TLK1	Q9UKI8	766 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ATM	Q13315	3056 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PQM1	296 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	BTN3A3	O00478	584 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF195	O14628	629 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GAT1	O43505	415 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFSF14	O43557	240 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NOBOX	O60393	691 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2B3	O76000	313 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A5	O76082	557 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QB	P02746	253 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS3BP	Q08380	585 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TGIF1	Q15583	401 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TAB1	Q15750	504 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	AANAT	Q16613	207 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OXR1	Q8N573	874 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SGTB	Q96EQ0	304 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K3	Q99759	626 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MKLN1	Q9UL63	735 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA2	Q9UM82	520 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		6.87	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EML5	Q05BV3	1969 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00587	B1AMM8	73 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC30A4	O14863	429 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CFLAR	O15519	480 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CS	O75390	466 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RFPL3	O75679	317 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UBXN7	O94888	489 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF250	P15622	560 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DPP6	P42658	865 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	STAR	P49675	285 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PRLHR	P49683	370 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EFR3A	Q14156	821 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2L2	Q8NH16	312 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NDNF	Q8TB73	568 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ST8SIA2	Q92186	375 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	RCN3	Q96D15	328 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT9	Q9BTE0	207 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COA4	Q9NYJ1	87 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	USP22	Q9UPT9	525 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TPP1	O14773	563 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHGA12	O60330	932 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MED26	O95402	600 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC16A8	O95907	504 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HPGD	P15428	266 aa		6.86	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GLB1	P16278	677 aa		6.86	□□□□□ -1.31

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