RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596351.5

LTBP4-215, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-215	ENST00000596351	CUL3	Q13618	768 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TESK1	Q15569	626 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	XPR1	Q9UBH6	696 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	MPDZ	O75970	2070 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351		A0A1B0GTL3	188 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	WDR1	O75083	606 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC35E2	P0CK97	266 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CAPN3	P20807	821 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PIK3R1	P27986	724 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SERPINB3	P29508	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PHB	P35232	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CCNG1	P51959	295 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	WNT3	P56703	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TRAF3	Q13114	568 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	MYBPH	Q13203	477 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	BIK	Q13323	160 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	NTRK2	Q16620	822 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	MMP21	Q8N119	569 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	NRGN	Q92686	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DIO2	Q92813	273 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SERPINI1	Q99574	410 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ACAN	P16112	2415 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PPP6C	O00743	305 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	HCN1	O60741	890 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SEMA3D	O95025	777 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	KLK1	P06870	262 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TSPAN8	P19075	237 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	GDF1	P27539	372 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	MAGEA12	P43365	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DLX5	P56178	289 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	NNAT	Q16517	81 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	LIX1	Q8N485	282 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ZFHX3	Q15911	3703 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	ABCA4	P78363	2273 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LTBP4-215	ENST00000596351	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	STX16	O14662	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	INHBA	P08476	426 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	NT5E	P21589	574 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	GALNS	P34059	522 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LTBP4-215	ENST00000596351	XK	P51811	444 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms