RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594661.5

PNKP-204, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 2

Gene PNKP, Length 2,111 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-204ENST00000594661 CCDC115Q96NT0 180 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 EBPLQ9BY08 206 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.6□□□□□ -0.07
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PNKP-204ENST00000594661 Q96MT0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
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PNKP-204ENST00000594661 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 GPR85P60893 370 aa14.59□□□□□ -0.07
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PNKP-204ENST00000594661 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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PNKP-204ENST00000594661 IGFALSP35858 605 aa14.59□□□□□ -0.07
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PNKP-204ENST00000594661 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 PDXPQ96GD0 296 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 HYLS1Q96M11 299 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-204ENST00000594661 IL17FQ96PD4 163 aa14.59□□□□□ -0.07
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