RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 GSTA2P09210 222 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CD99P14209 185 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 BMP5P22003 454 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SSTR4P31391 388 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 BSGP35613 385 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DUSP8Q13202 625 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SETDB1Q15047 1291 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ACTR8Q9H981 624 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DOCK7Q96N67 2140 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 OR6C76A6NM76 312 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 HSPB2A8KAH6 182 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CRABP2P29373 138 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 MAGEA4P43358 317 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ASCL1P50553 236 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXW4P57775 412 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RPS6KA2Q15349 733 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CEBPEQ15744 281 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 HSPB2Q16082 182 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DIO2Q92813 273 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RASSF1Q9NS23 344 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ESYT3A0FGR9 886 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM221AA4D161 298 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 H0YIV9 168 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GBAP04062 536 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CASQ1P31415 396 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ARFIP1P53367 373 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PFKFB4Q16877 469 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 LIPJQ5W064 366 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TAGAPQ8N103 731 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RILPQ96NA2 401 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ABCA4P78363 2273 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SYCE1LA8MT33 242 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SYT5O00445 386 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DVL2O14641 736 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CT62P0C5K7 136 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GFAPP14136 432 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 STX2P32856 288 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PHEXP78562 749 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CUL3Q13618 768 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TBCELQ5QJ74 424 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 NUDT13Q86X67 352 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 UBQLN3Q9H347 655 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CBLCQ9ULV8 474 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ACOT9Q9Y305 439 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 HMX2A2RU54 273 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 A6NNC1 897 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 EPPINO95925 133 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC35E2P0CK97 266 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 KLK2P20151 261 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GALNSP34059 522 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PIK3CGP48736 1102 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 NEK2P51955 445 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC7A5Q01650 507 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GUCY2DQ02846 1103 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM198Q66K66 360 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CDC20BQ86Y33 519 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 LACC1Q8IV20 430 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 REPS1Q96D71 796 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TIMP4Q99727 224 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RAB17Q9H0T7 212 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR41Q9HAD4 459 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-207ENST00000530513 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms