RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 BCKDKO14874 412 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 CEACAM7Q14002 265 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PDK3Q15120 406 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TAF13Q15543 124 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 BTBD16Q32M84 506 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ADCK1Q86TW2 530 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 OR2T11Q8NH01 316 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SFXN5Q8TD22 340 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 GRHL3Q8TE85 626 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 RNF31Q96EP0 1072 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MCHR1Q99705 422 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 KRBA1A5PL33 1030 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 LRIT2A6NDA9 550 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PROM1O43490 865 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ACPPP15309 386 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 FPR1P21462 350 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 BCKDHBP21953 392 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TACR1P25103 407 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA3P26006 1051 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 CHN2P52757 468 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL12Q53G59 568 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TSC22D3Q99576 134 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ADI1Q9BV57 179 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ASIC5Q9NY37 505 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 WDR81Q562E7 1941 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GX78 115 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 HCRTR2O43614 444 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 IGHEP01854 428 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 POU2F1P14859 743 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ST6GAL1P15907 406 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEA8P43361 318 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 XKR7Q5GH72 579 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 HSDL2Q6YN16 418 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 OR4C6Q8NH72 309 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 DOK4Q8TEW6 326 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SMPDL3BQ92485 455 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 POMT2Q9UKY4 750 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MED31Q9Y3C7 131 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 R4GN57 208 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PEX2P28328 305 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TRAM2Q15035 370 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 CD93Q9NPY3 652 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 PADI1Q9ULC6 663 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 RAB26Q9ULW5 256 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 GNB5O14775 395 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SIGLEC6O43699 453 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 C1QAP02745 245 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 GPR19Q15760 415 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC115Q96NT0 180 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM2Q9C040 744 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 LYRM4Q9HD34 91 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 VAPAQ9P0L0 249 aa7.81□□□□□ -1.16
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