RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482183.1

CAPN8-208, Transcript of calpain 8, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN8, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8-208ENST00000482183 LRRC32Q14392 662 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 IRF4Q15306 451 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RAB30Q15771 203 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MPEG1Q2M385 716 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C12orf73Q69YU5 71 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 OR2L3Q8NG85 312 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 OR52J3Q8NH60 311 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 NT5CQ8TCD5 201 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RSC1A1Q92681 617 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 TMCO6Q96DC7 493 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SERINC2Q96SA4 455 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 CSF3RQ99062 836 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MGLLQ99685 303 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MENTQ9BUN1 341 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 NUAK2Q9H093 628 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 OR51I1Q9H343 314 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 NTMQ9P121 344 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MSRAQ9UJ68 235 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 AGAP5A6NIR3 686 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 METTL15A6NJ78 407 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 LRRC72A6NJI9 287 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 PCDH17O14917 1159 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MAN1A2O60476 641 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 UPK1BO75841 260 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RAB36O95755 333 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 B3GALT4O96024 378 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SERPIND1P05546 499 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GUSBP08236 651 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ADORA3P0DMS8 318 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GAAP10253 952 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 DRD1P21728 446 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GALP22466 123 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 CD6P30203 668 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SLC15A1P46059 708 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MASP1P48740 699 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 PCYT1AP49585 367 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RORCP51449 518 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 BIKQ13323 160 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 AQP6Q13520 282 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SEC23BQ15437 767 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SPHARQ15513 63 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 MED22Q15528 200 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 DUSP7Q16829 419 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 GPAT3Q53EU6 434 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 DEF8Q6ZN54 512 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 CDK20Q8IZL9 346 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPN8-208ENST00000482183 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms