RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL7AQ4VC05 210 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 XKR3Q5GH77 459 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FGD3Q5JSP0 725 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM225Q6GV28 225 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FJX1Q86VR8 437 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GPBP1Q86WP2 473 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PEX13Q92968 403 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 OMDQ99983 421 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NLNQ9BYT8 704 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DCLK3Q9C098 648 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 LRP12Q9Y561 859 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF123Q5XPI4 1314 aa4.2□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PPI3 338 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR11A4FU01 709 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 M0QX08 132 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 WRBO00258 174 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNGR3O43761 229 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CTAG2O75638 210 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT33AO76009 404 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NEBLO76041 1014 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 STK17BO94768 372 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PMS2P2O95744 297 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR2MP0CAP2 368 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 STAG3L3P0CL85 134 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMTP11086 282 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DOBP13765 273 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB2P14652 356 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 AMD1P17707 334 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN8P19075 237 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MSH3P20585 1137 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 MX1P20591 662 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXA5P20719 270 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PROZP22891 400 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CA6P23280 308 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GLRA1P23415 457 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FNTAP49354 379 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 BNC1Q01954 994 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 NAAAQ02083 359 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 DMTNQ08495 405 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 FGL1Q08830 312 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 BST1Q10588 318 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAF2Q12933 501 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAF3Q13114 568 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KIR2DS3Q14952 304 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMK4Q16566 473 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 Q4G0T1 1027 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 ASRGL1Q7L266 308 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PIP4P1Q86T03 277 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 SERINC5Q86VE9 423 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 VSTM4Q8IW00 320 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 GPC2Q8N158 579 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC43Q8N309 656 aa4.19□□□□□ -1.74
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP8Q8N3A8 854 aa4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms