RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NELL2Q99435 816 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 JAM3Q9BX67 310 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ITM2BQ9Y287 266 aa15.97■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 M0R129 80 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SYT5O00445 386 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PRNPP04156 253 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN19P0C672 248 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GABRA5P31644 462 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SOX3P41225 446 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 RAB25P57735 213 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SYT14P1Q58G82 188 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 LILRA6Q6PI73 481 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 USP30Q70CQ3 517 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PDZD3Q86UT5 571 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C17orf64Q86WR6 236 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM25Q86YD3 366 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 LAX1Q8IWV1 398 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C17orf50Q8WW18 174 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FRMD6Q96NE9 622 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GDF15Q99988 308 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TEX12Q9BXU0 123 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GON7Q9BXV9 100 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 NIPAL2Q9H841 368 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MED17Q9NVC6 651 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FABP12A6NFH5 140 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HMGN4O00479 90 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CHST10O43529 356 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CCL5P13501 91 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TYRP14679 529 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 BSGP35613 385 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GIPRP48546 466 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 REEP5Q00765 189 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 QPRTQ15274 297 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SPATC1Q76KD6 591 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GALNT12Q8IXK2 581 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM163Q8TC26 289 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 UFD1Q92890 307 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RFKQ969G6 155 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RNF121Q9H920 327 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DIABLOQ9NR28 239 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PRU2 124 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PLPP1O14494 284 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TGM5O43548 720 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CDRT1O95170 752 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GPAT3Q53EU6 434 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MZT2AQ6P582 158 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 22
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 NOXA1Q86UR1 476 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TTLQ8NG68 377 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms