RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACOX3O15254 700 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBX19O60806 448 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBX6O95503 412 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GBAP04062 536 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINE1P05121 402 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDCP20711 480 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH3A1P30838 453 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPIP34949 423 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASMTP46597 345 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINB4P48594 390 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PER3P56645 1201 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRG3P56975 720 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC37A1P57057 533 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-8P63133 956 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMGCS1Q01581 520 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP4K2Q12851 820 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEBPEQ15744 281 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMU1Q2TAY7 513 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIGGQ5H8A4 983 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBCELQ5QJ74 424 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FHL5Q5TD97 284 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTFR2Q6P444 385 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTL4Q6ZR62 310 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GK5Q6ZS86 529 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EID3Q8N140 333 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NATD1Q8N6N6 113 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTERF3Q96E29 417 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCRL1Q96LA6 429 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASL10BQ96S79 203 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBEGFQ99075 208 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LUZP4Q9P127 313 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMM22Q9Y584 194 aa7.95□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLOD5A6NK44 160 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC36A6NLP5 189 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACOT7O00154 380 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TP53I11O14683 189 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGRMC2O15173 223 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COQ9O75208 318 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPAG7O75391 227 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2J2O76002 312 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL3P08700 152 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF24P17028 368 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAGAP17050 411 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NT5EP21589 574 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINB3P29508 390 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NTSP30990 170 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH9A1P49189 494 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TDGF1P3P51864 188 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXA1P55317 472 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ID2Q02363 134 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NR6A1Q15406 480 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGFBP7Q16270 282 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.94□□□□□ -1.14
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms