RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TLE3Q04726 772 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TRAM2Q15035 370 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf80Q86SX3 495 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ9Q92806 393 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PRODH2Q9UF12 536 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HHLA1C9JL84 531 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CCL16O15467 120 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RBBP9O75884 186 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EDN1P05305 212 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RORAP35398 523 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEA11P43364 429 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB2A2Q13296 93 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SPATC1Q76KD6 591 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KLK6Q92876 244 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf34Q96L11 122 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF175Q9Y473 711 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TAF1P21675 1872 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CENPBD1B2RD01 187 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 G3V2L1 256 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PPM1BO75688 479 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF30P17039 623 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 THBS2P35442 1172 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEA6P43360 314 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PRKCZQ05513 592 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NTRK2Q16620 822 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EDARQ9UNE0 448 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GVT2 93 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PCDH17O14917 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 UQCRC1P31930 480 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 GPR17Q13304 367 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UPP1Q16831 310 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 OR7G2Q8NG99 324 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NSMAFQ92636 917 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PEX13Q92968 403 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DOHHQ9BU89 302 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MMP28Q9H239 520 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TAC3Q9UHF0 121 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GLOD5A6NK44 160 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF11O60813 436 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF623O75123 536 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACTL6BO94805 426 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GPR89BP0CG08 455 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PRKACBP22694 351 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN2DP55273 166 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GABARAPL2P60520 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RAB31Q13636 194 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TFAP2CQ92754 450 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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