RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 OR10H2O60403 315 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 IMPDH2P12268 514 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 IL12RB1P42701 662 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 MAGEA2P43356 314 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SMSP52788 366 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ERVK-21P61565 698 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CDK3Q00526 305 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PLAG1Q6DJT9 500 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DOK1Q99704 481 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 BEX2Q9BXY8 128 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SLC23A2Q9UGH3 650 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 A0A1W2PQU0 124 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 AGAP5A6NIR3 686 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FAAHO00519 579 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 IGHA2P01877 340 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CELP19835 753 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 GPR4P46093 362 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CD97P48960 835 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CDH11P55287 796 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DEFB134Q4QY38 66 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SPATC1Q76KD6 591 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PIK3R3Q92569 461 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 COQ8BQ96D53 544 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 C7orf34Q96L11 122 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF221Q9UK13 617 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 AGAP14A8MT82 685 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ADAP00813 363 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CERS1P27544 350 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 HSD17B2P37059 387 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 P2RY2P41231 377 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CKAP5Q14008 2032 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF77Q15935 545 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DESI1Q6ICB0 168 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CDC73Q6P1J9 531 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 VN1R5Q7Z5H4 357 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SMARCD2Q92925 531 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DPEP2Q9H4A9 486 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ACER3Q9NUN7 267 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DKK3Q9UBP4 350 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SCN2BO60939 215 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 UPK1BO75841 260 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CD72P21854 359 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ITGB8P26012 769 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SCN1BQ07699 218 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 GBX1Q14549 363 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 QPRTQ15274 297 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZFP69Q49AA0 526 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PLET1Q6UQ28 207 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 GPR151Q8TDV0 419 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 UFD1Q92890 307 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FGF13Q92913 245 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 LGR4Q9BXB1 951 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGAP33O14559 1287 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PLOD3O60568 738 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PRG2P13727 222 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 IL1RNP18510 177 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 PTPN6P29350 595 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SSTR4P31391 388 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 SOX9P48436 509 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CENPAP49450 140 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF45Q02386 682 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 CST6Q15828 149 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 DDI2Q5TDH0 399 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF549-202ENST00000376233 STEAP3Q658P3 488 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms