RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ELOA3Q8NG57 546 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TANKQ92844 425 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TLCD1Q96CP7 247 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MVB12AQ96EY5 273 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DERL2Q9GZP9 239 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM60AQ9NP50 221 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TREX1Q9NSU2 369 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 H0YC42 278 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ITGA10O75578 1167 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TIPRLO75663 272 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GPR75O95800 540 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-19P01714 112 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINE1P05121 402 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 NAA20P61599 178 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK14Q6IE38 97 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CUZD1Q86UP6 607 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 ASB11Q8WXH4 323 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL8Q96CD0 374 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 APOPT1Q96IL0 206 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SH3GL1Q99961 368 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NTMT1Q9BV86 223 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MROH6A6NGR9 719 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF2O60811 474 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR2J2O76002 312 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FAM107AO95990 144 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CSTAP01040 98 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB5P36952 375 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 STAT5AP42229 794 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB4P48594 390 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 BTG2P78543 158 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CUL3Q13618 768 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FRMPD2BQ6IN97 320 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR7G3Q8NG95 312 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GRHL3Q8TE85 626 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SGCZQ96LD1 299 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PELI2Q9HAT8 420 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 NPHS2Q9NP85 383 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ISPDA4D126 451 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 LRRTM2O43300 516 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FZD6O60353 706 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 ALBP02768 609 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 IL3P08700 152 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 HK1P19367 917 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A2P23975 617 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 AHRP35869 848 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A6P48664 564 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CCT3P49368 545 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PRKAA2P54646 552 aa4.17□□□□□ -1.74
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