RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346562.6

NPAS3-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS3, Length 5,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-201ENST00000346562 LAPTM4AQ15012 233 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 EMC10Q5UCC4 262 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CEACAM19Q7Z692 300 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 NEIL3Q8TAT5 605 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 CREBZFQ9NS37 354 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 C2orf78A6NCI8 922 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SEMA4FO95754 770 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 HHEXQ03014 270 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PDSS2Q86YH6 399 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 IGSF8Q969P0 613 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TBX10O75333 385 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 PITX2Q99697 317 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.08■■□□□ 1.13
NPAS3-201ENST00000346562 A0A0G2JMP0 313 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ISPDA4D126 451 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 H0YAE9 185 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 RAC2P15153 192 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 TUBG1P23258 451 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 FGL2Q14314 439 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 NPY5RQ15761 445 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ATAD3CQ5T2N8 411 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.08■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.08■■□□□ 1.12
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NPAS3-201ENST00000346562 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ASB12Q8WXK4 309 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 F2RL3Q96RI0 385 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 RSU1Q15404 277 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 A8MVJ9 347 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 RHCEP18577 417 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 OR51A7Q8NH64 312 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 CDH20Q9HBT6 801 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SLC18B1Q6NT16 456 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SNED1Q8TER0 1413 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 CLCA1A8K7I4 914 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 FAM189A1O60320 539 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 MANEALQ5VSG8 457 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 UEVLDQ8IX04 471 aa22.07■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 GCGRP47871 477 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 BDH1Q02338 343 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 AP1S3Q96PC3 154 aa22.06■■□□□ 1.12
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NPAS3-201ENST00000346562 TRAV6A0A075B6T7 132 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SMIM30A4D0T7 59 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 AGAP5A6NIR3 686 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 PRAMEF2O60811 474 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 POU3F4P49335 361 aa22.06■■□□□ 1.12
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NPAS3-201ENST00000346562 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 PELI2Q9HAT8 420 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 TAS2R38P59533 333 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF45Q02386 682 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SRYQ05066 204 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 MOGQ16653 247 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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NPAS3-201ENST00000346562 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 H3BSA7 217 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ANKRD28O15084 1053 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 RCAN2Q14206 197 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 PEX11GQ96HA9 241 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 PRLP01236 227 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 NPR2P20594 1047 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 IL17FQ96PD4 163 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 SYT4Q9H2B2 425 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 NANSQ9NR45 359 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 NDUFV2P19404 249 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 HTR1EP28566 365 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 NSDHLQ15738 373 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS3-201ENST00000346562 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.05■■□□□ 1.12
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