RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 OR5K2Q8NHB8 316 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A46Q96AG3 418 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 COX14Q96I36 57 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MENTQ9BUN1 341 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 NOTCH4Q99466 2003 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 PRKYO43930 277 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS11DO60235 418 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 RAB36O95755 333 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 ADRB3P13945 408 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 CPEP16870 476 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 S100A1P23297 94 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 NR4A2P43354 598 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 BNC1Q01954 994 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 LAX1Q8IWV1 398 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 OR52I1Q8NGK6 324 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 SNTG1Q9NSN8 517 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 CMAHPQ9Y471 501 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD1-201ENST00000331462 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFS4O43181 175 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 SH3BP5O60239 455 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 RPN2P04844 631 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ACADMP11310 421 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ADH5P11766 374 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 RFX2P48378 723 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 COMTD1Q86VU5 262 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 RGMAQ96B86 450 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF221Q9UK13 617 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 COL4A3Q01955 1670 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 RGS5O15539 181 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 KRT8P05787 483 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TRAPPC2P0DI81 140 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TRAPPC2BP0DI82 140 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 CDK5Q00535 292 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 SYPL1Q16563 259 aa21.32■■□□□ 1
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HOXD1-201ENST00000331462 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf94Q6P1W5 598 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 AMZ2Q86W34 360 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf40Q86WS4 652 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 BBS10Q8TAM1 723 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 MED18Q9BUE0 208 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 C5AR2Q9P296 337 aa21.32■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRSQ13332 1948 aa21.31■■□□□ 1
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HOXD1-201ENST00000331462 HIDE1A8MVS5 230 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 STK25O00506 426 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 SEC14L5O43304 696 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 IL7P13232 177 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TNNI3P19429 210 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 MMP11P24347 488 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 PPP2R1BP30154 601 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 GAS1P54826 345 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 PAQR6Q6TCH4 344 aa21.31■■□□□ 1
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HOXD1-201ENST00000331462 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 IQCF1Q8N6M8 205 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 MORN4Q8NDC4 146 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 OR51I1Q9H343 314 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.31■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 IRGMA1A4Y4 181 aa21.3■■□□□ 1
HOXD1-201ENST00000331462 OR12D1P0DN82 309 aa21.3■■□□□ 1
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