RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329474.6

CARMIL1-201, Transcript of capping protein regulator and myosin 1 linker 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CARMIL1, Length 5,431 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1-201ENST00000329474 RETP07949 1114 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 BMP8BP34820 402 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 MAGEA8P43361 318 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DNASE1L1P49184 302 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 OSTF1Q92882 214 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 OR6C74A6NCV1 312 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ABLIM3O94929 683 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RENP00797 406 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CD2P06729 351 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ODF4Q2M2E3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DEFB134Q4QY38 66 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RTL10Q7L3V2 364 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 AVL9Q8NBF6 648 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ASB11Q8WXH4 323 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TMEM19Q96HH6 336 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DPH7Q9BTV6 452 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 P2RY12Q9H244 342 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 MED31Q9Y3C7 131 aa9.5□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RFXAPO00287 272 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CCRL2O00421 344 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ENTPD6O75354 484 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 KLHL18O94889 574 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CDRT1O95170 752 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 IFNA6P05013 189 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CCR2P41597 374 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 CST6Q15828 149 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ATCAYQ86WG3 371 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZNF527Q8NB42 609 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZNF480Q8WV37 535 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DGAT2Q96PD7 388 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 IL21RQ9HBE5 538 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RDH14Q9HBH5 336 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RAB36O95755 333 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TACSTD2P09758 323 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PSKH1P11801 424 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PIGAP37287 484 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GPR4P46093 362 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 SLC7A9P82251 487 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PUDPQ08623 228 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ENPP2Q13822 863 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DSG2Q14126 1118 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 COX20Q5RI15 118 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 LHX8Q68G74 356 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PJA1Q8NG27 643 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 SMARCD2Q92925 531 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 DSN1Q9H410 356 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 A0A1B0GVT2 93 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 TARM1B6A8C7 271 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 UGDHO60701 494 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 RHCEP18577 417 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GSTM2P28161 218 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 GINS1Q14691 196 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 PIGKQ92643 395 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 NDC1Q9BTX1 674 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 NTMT1Q9BV86 223 aa9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CARMIL1-201ENST00000329474 Q9N2J8 555 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms