RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 OR5H6Q8NGV6 325 aa19.26■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PATE3B3GLJ2 98 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RGS10O43665 173 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CYP4B1P13584 511 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 LAIR1Q6GTX8 287 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RNF165Q6ZSG1 346 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A45Q8N413 288 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SVOPLQ8N434 492 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 LSMEM1Q8N8F7 131 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ACTL8Q9H568 366 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ELOVL6Q9H5J4 265 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TOR4AQ9NXH8 423 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R9Q9NYW1 312 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA3DO95025 777 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NPPAP01160 153 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PDYNP01213 254 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GGT1P19440 569 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PRKCDQ05655 676 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FADDQ13158 208 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DUOXA1Q1HG43 343 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FRG2Q64ET8 278 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ADNP2Q6IQ32 1131 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ARL14Q8N4G2 192 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FRG2BQ96QU4 278 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2B28Q9BY64 529 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 KCNN3Q9UGI6 736 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 BTBD3Q9Y2F9 522 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JMP0 313 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN24A6NM45 220 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf71A8MTZ7 269 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 H0YIV9 168 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR3A3P47888 321 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 AMER2Q8N7J2 671 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 WDR20Q8TBZ3 569 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SELENOMQ8WWX9 145 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 EFCAB11Q9BUY7 163 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TWSG1Q9GZX9 223 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CCL27Q9Y4X3 112 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PIPSLA2A3N6 862 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP9O95302 570 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FASLGP48023 281 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 YIF1BQ5BJH7 314 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NRARPQ7Z6K4 114 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FAM129CQ86XR2 697 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 EID3Q8N140 333 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RNF175Q8N4F7 328 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC47A1Q96FL8 570 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF583Q96ND8 569 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CAPN10Q9HC96 672 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DMDP11532 3685 aa19.24■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0X1KG70 313 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQ72 361 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR6C74A6NCV1 312 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PPM1DO15297 605 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A6O15403 523 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DFNA5O60443 496 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GIMD1P0DJR0 217 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OGFOD3Q6PK18 319 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF740Q8NDX6 193 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR2L3Q8NG85 312 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3R3Q92569 461 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NEDD4LQ96PU5 975 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PHOX2BQ99453 314 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ACPTQ9BZG2 426 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RIBC2Q9H4K1 309 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ISM1B1AKI9 464 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MEN1O00255 615 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GSTA4O15217 222 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FAM20BO75063 409 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DDX5P17844 614 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 HMGCS1Q01581 520 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 IL18R1Q13478 541 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NR6A1Q15406 480 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-BQ31612 363 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MED27Q6P2C8 311 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FAM109AQ8N4B1 249 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR7G3Q8NG95 312 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR10G6Q8NH81 332 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FBLIM1Q8WUP2 373 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CDADC1Q9BWV3 514 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PELI2Q9HAT8 420 aa19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms