RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211998.9

VCL-201, Transcript of vinculin, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene VCL, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCL-201ENST00000211998 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.812e-47■■■■□ 20.5
VCL-201ENST00000211998 ST7LQ8TDW4 575 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NUS1Q96E22 293 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SLC22A14Q9Y267 594 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 LCHNA4D1U4 455 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 AP1G1O43747 822 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 MAOAP21397 527 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 DDOSTP39656 456 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 MAGEB1P43366 347 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CREB5Q02930 508 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TIGD5Q53EQ6 642 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TMEM205Q6UW68 189 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 IDO2Q6ZQW0 420 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ZFAND4Q86XD8 727 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 AVL9Q8NBF6 648 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 DCUN1D4Q92564 292 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CHFRQ96EP1 664 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PTTG3PQ9NZH4 202 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PIP5K1CO60331 668 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 HPGDSO60760 199 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 OR8U9P0C7N5 309 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 UBBP0CG47 229 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SLC35E2BP0CK96 405 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 JUNDP17535 347 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 RAB6AP20340 208 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 GIFP27352 417 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KCNQ1P51787 676 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SEC13P55735 322 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 GNMTQ14749 295 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TCEAL6Q6IPX3 200 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 DPPA2Q7Z7J5 298 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TMPRSS12Q86WS5 348 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KCNN1Q92952 543 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NT5C3BQ969T7 300 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SUSD3Q96L08 255 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CENPMQ9NSP4 180 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PARPBPQ9NWS1 579 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NLGN3Q9NZ94 848 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ACSL6Q9UKU0 697 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CLDN24A6NM45 220 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PTNP21246 168 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PYCR1P32322 319 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CNR2P34972 360 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 RABGGTBP53611 331 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CHAF1BQ13112 559 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 OXA1LQ15070 435 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NRSN1Q8IZ57 195 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SLC5A8Q8N695 610 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KCNJ9Q92806 393 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TMEM41AQ96HV5 264 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 OR2M2Q96R28 347 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NIPAL2Q9H841 368 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 VNN3Q9NY84 501 aa10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 OR7A17O14581 309 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 HOXC12P31275 282 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 CSKP41240 450 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ST8SIA4Q92187 359 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 DUXAA6NLW8 204 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 EDNRBP24530 442 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SHMT2P34897 504 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 ART1P52961 327 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 TRAM2Q15035 370 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PDGFRLQ15198 375 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 PEBP4Q96S96 227 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 C12orf57Q99622 126 aa9.99□□□□□ -0.81
VCL-201ENST00000211998 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms