RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acad8Q9D7B6 413 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ssr3Q9DCF9 185 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr88Q9EPB7 384 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10718D3Z1I7 227 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Crisp4E9PVG4 293 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr420E9Q4G0 321 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Etv1P41164 477 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Flt3lgP49772 232 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gfi1P70338 423 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GaaP70699 953 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spryd7Q3TFQ1 196 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mib1Q80SY4 1006 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apoa5Q8C7G5 368 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 March11Q8CBH7 400 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Padi6Q8K3V4 682 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adgrg3Q8R0T6 542 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sirt4Q8R216 333 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Osgin1Q8VC10 478 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akr1c20Q8VC77 323 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Grk5Q8VEB1 590 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr986Q8VFN6 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr202Q8VGQ3 307 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnttip1Q99LB0 328 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Etv5Q9CXC9 510 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spaca1Q9DA48 305 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam13cQ9DBR2 601 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc7a9Q9QXA6 487 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ReckQ9Z0J1 971 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itgb6Q9Z0T9 787 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl15A2AAX3 604 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SelenovD3YXG1 328 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plscr5J3QM92 274 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam181aJ3QNB7 292 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnk1O08581 336 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FhitO89106 150 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wnt4P22724 351 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cbx2P30658 519 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh10P70408 788 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pitx2P97474 317 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr15Q0VDU3 360 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EndouQ3V188 412 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Traf4Q61382 470 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem270Q6UJB9 264 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr728Q7TRM6 311 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgr15lQ80T54 456 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itln1bQ80ZA0 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DpcdQ8BPA8 203 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dync2li1Q8K0T2 351 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Get4Q9D1H7 327 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam174aQ9D3L0 190 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sec23bQ9D662 767 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tprg1lQ9DBS2 266 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr619E9PV95 320 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco5a1E9PVD9 850 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prdm13E9PZZ1 754 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r4K7N784 913 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PbsnO08976 174 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hax1O35387 280 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ring1O35730 406 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klrg1O88713 188 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr5P61965 334 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbx6P70327 436 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rit1P70426 219 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mmp11Q02853 492 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc61Q3UJV1 511 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc44a5Q5RJI2 710 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptx4Q6RUU0 478 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubr7Q8BU04 425 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr152Q8BXS7 511 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps9d1Q8C190 649 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phtf2Q8CB19 747 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FkrpQ8CG64 494 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tram2Q924Z5 370 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps29Q9QZ88 182 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr31F8VQN3 319 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem200cJ3QK46 637 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxb9P20615 250 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hsd3b1P24815 373 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PtgirP43252 415 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpina7P61939 418 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf149Q3U2C5 394 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem151bQ68FE7 561 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr769Q8K501 312 aa9.47□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glb1lQ8VC60 646 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.7 ms