RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LMNB1P20700 586 aa7.86□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNBD1Q8NA66 436 aa7.86□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GLTPD2A6NH11 291 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SRGNP10124 158 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 APLP1P51693 650 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ST5P78524 1137 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HTRA3P83110 453 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUP98P52948 1817 aa7.85□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM177BA6PVY3 158 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEFMP07197 916 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FSTL1Q12841 308 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HLFQ16534 295 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STYK1Q6J9G0 422 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NGEFQ8N5V2 710 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MASTLQ96GX5 879 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.84□□□□□ -1.15
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POTECB2RU33 542 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NFE2L2Q16236 605 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERFEQ4G0M1 354 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNKSR1Q969H4 720 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP350Q5VT06 3117 aa7.83□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYL6BP14649 208 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCC12Q96J65 1359 aa7.82□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RGL2O15211 777 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPR1P16066 1061 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IFFO2Q5TF58 517 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OLFM4Q6UX06 510 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIPK4P57078 832 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC93Q567U6 631 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SOGA3Q5TF21 947 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLRG1Q96E93 195 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.8□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNED1Q8TER0 1413 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GPTP24298 496 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RALBP1Q15311 655 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SUSD4Q5VX71 490 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NYXQ9GZU5 481 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LAMB2P55268 1798 aa7.79□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SCN4AP35499 1836 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANXA1P04083 346 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POTEIP0CG38 1075 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POTEJP0CG39 1038 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALDH1B1P30837 517 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDIA6Q15084 440 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEUROD2Q15784 382 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PROSER3Q2NL68 480 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CRY2Q49AN0 593 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC51AQ86UW1 340 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 JMYQ8N9B5 988 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERBB4Q15303 1308 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.78□□□□□ -1.16
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.77□□□□□ -1.17
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COL4A5P29400 1685 aa7.77□□□□□ -1.17
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NTSR2O95665 410 aa7.77□□□□□ -1.17
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRT24Q2M2I5 525 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms