RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 F13A1P00488 732 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 NEK1Q96PY6 1258 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRT-210ENST00000617474 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.02■□□□□ 0.47
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PTPRT-210ENST00000617474 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa17.97■□□□□ 0.47
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PTPRT-210ENST00000617474 PKP1Q13835 747 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC181Q5TID7 509 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRT-210ENST00000617474 MICU3Q86XE3 530 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRT-210ENST00000617474 ZSCAN12O43309 604 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRT-210ENST00000617474 RAI14Q9P0K7 980 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF213O14771 459 aa17.96■□□□□ 0.47
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PTPRT-210ENST00000617474 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa17.96■□□□□ 0.47
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PTPRT-210ENST00000617474 HS1BP3Q53T59 392 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 CHST3Q7LGC8 479 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 CDR1P51861 262 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRT-210ENST00000617474 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM63CQ9P1W3 806 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 PHF8Q9UPP1 1060 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 KIAA1328Q86T90 577 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 AOPEPQ8N6M6 819 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 KCNH5Q8NCM2 988 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRT-210ENST00000617474 MSH6P52701 1360 aa17.94■□□□□ 0.46
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