RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 AMPHP49418 695 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNC4Q03721 635 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPYL6Q8N831 410 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 CRB1P82279 1406 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM83GA6ND36 823 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 HSCBQ8IWL3 235 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NUTM2FA1L443 756 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP4CP60510 307 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CERKQ8TCT0 537 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 LNPKQ9C0E8 428 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 HMMRO75330 724 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 PADI6Q6TGC4 694 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC13Q8NBP0 860 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 BCL11AQ9H165 835 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS12O14924 1447 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF26B4DH59 902 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC45O75419 566 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 DCTN1Q14203 1278 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM10Q7L590 875 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 STK31Q9BXU1 1019 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 MSH6P52701 1360 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K5Q99683 1374 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CASC1Q6TDU7 716 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP10DQ9P241 1426 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNA6P17658 529 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXC9P31274 260 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 DCTPP1Q9H773 170 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX21Q969T3 373 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 EYA1Q99502 592 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-222ENST00000592408 APLP1P51693 650 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NWD1Q149M9 1564 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 ABTB2Q8N961 1025 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF516Q92618 1163 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 MTRQ99707 1265 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF40O75150 1001 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 PTMSP20962 102 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPA2P54652 639 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP85Q6P2H3 762 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NFAT5O94916 1531 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 LTN1O94822 1766 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NCAPD2Q15021 1401 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAI3P08754 354 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC22Q5TAA0 569 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF1AQ12756 1690 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAI2P04899 355 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB7P09629 217 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.5 ms