RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPFIA3O75145 1194 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BRD1O95696 1058 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VEGFBP49765 207 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PGBD3Q8N328 593 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL26A1Q96A83 441 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLRG1Q96E93 195 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ITGA6P23229 1130 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZIC5Q96T25 663 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TOPBP1Q92547 1522 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PNR3 127 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DBN1Q16643 649 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RTN1Q16799 776 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX20Q5RI15 118 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLK14Q9P0G3 267 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C16orf46Q6P387 395 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.48□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DGKZQ13574 1117 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.47□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CUX1P39880 1505 aa9.46□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDC14CA4D256 554 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H7C1W4 665 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABL1P00519 1130 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 THBS1P07996 1170 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SERPINB4P48594 390 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EFHC2Q5JST6 749 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYO19Q96H55 970 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.46□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MTMR3Q13615 1198 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SUSD3Q96L08 255 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MTMR7Q9Y216 660 aa9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BCS1LQ9Y276 419 aa9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNA1Q09470 495 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NLRP8Q86W28 1048 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.43□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BM21 787 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNFRSF10BO14763 440 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SV2AQ7L0J3 742 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HELQQ8TDG4 1101 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IFT43Q96FT9 208 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.42□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPR25O00155 361 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM26DQ5JW98 314 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GMCL1Q96IK5 515 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STIM2Q9P246 746 aa9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HIF1AQ16665 826 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BNIP3LO60238 219 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP63Q96MT8 703 aa9.39□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms