RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, human

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-215	ENST00000589536	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.29	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	NPHP1	O15259	732 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	LMNB1	P20700	586 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	NFKBIE	O00221	500 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	TOMM70	O94826	608 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
GRN-215	ENST00000589536	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	SRGN	P10124	158 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	RIPK4	P57078	832 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	HLF	Q16534	295 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	C21orf2	O43822	256 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GRN-215	ENST00000589536	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	NUP98	P52948	1817 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	MYL6B	P14649	208 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
GRN-215	ENST00000589536	NPR1	P16066	1061 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	APLP1	P51693	650 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	PDIA6	Q15084	440 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	FSTL1	Q12841	308 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GRN-215	ENST00000589536	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	CHL1	O00533	1208 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	GPT	P24298	496 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	CCDC93	Q567U6	631 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	ANXA1	P04083	346 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GRN-215	ENST00000589536	POTEC	B2RU33	542 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	ALDH1B1	P30837	517 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	NTSR2	O95665	410 aa		32	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	SNED1	Q8TER0	1413 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	31.98	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	NECTIN2	Q92692	538 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GRN-215	ENST00000589536	COPS6	Q7L5N1	327 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GRN-215	ENST00000589536	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.94	■■■□□ 2.7

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