RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 LGR6Q9HBX8 967 aa7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP27B1O15528 508 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 NEFMP07197 916 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEAQ6S8J7 498 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 WWC1Q8IX03 1113 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.92□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PHKG2P15735 406 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PACS2Q86VP3 889 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 IL17REQ8NFR9 667 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF521Q96K83 1311 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K5Q99683 1374 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 NECTIN2Q92692 538 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SPG7Q9UQ90 795 aa7.9□□□□□ -1.14
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 TNS2Q63HR2 1409 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ3O43525 872 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 DDB1Q16531 1140 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT24Q2M2I5 525 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 BARGINQ6ZT62 677 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.89□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC5O00471 708 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.88□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS12O14924 1447 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 DGAT1O75907 488 aa7.87□□□□□ -1.15
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CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A6Q13433 755 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC27Q2M243 656 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB4P16144 1822 aa7.87□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ2O43526 872 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 MBIPQ9NS73 344 aa7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 RXRBP28702 533 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 CABP4P57796 275 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE3BQ13370 1112 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PKDCCQ504Y2 493 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR63Q8IWG1 891 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPYL6Q8N831 410 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 MTRQ99707 1265 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 C5P01031 1676 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 MRC1P22897 1456 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF853P0CG23 659 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 TEFQ10587 303 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD10Q14728 455 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF5Q96JK2 942 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.84□□□□□ -1.15
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