RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.19■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.18■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.18■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 NFKBIEO00221 500 aa24.18■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.18■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 SRGNP10124 158 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 STYK1Q6J9G0 422 aa24.16■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 NPHP1O15259 732 aa24.15■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 CNKSR1Q969H4 720 aa24.15■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 SLX4Q8IY92 1834 aa24.14■■□□□ 1.46
CTIF-206ENST00000588345 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 CACNA1SQ13698 1873 aa24.13■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 C21orf2O43822 256 aa24.13■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 MASTLQ96GX5 879 aa24.13■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.12■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 HLFQ16534 295 aa24.12■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 RRAGCQ9HB90 399 aa24.12■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 GLTPD2A6NH11 291 aa24.11■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 APLP1P51693 650 aa24.11■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.11■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 NUP98P52948 1817 aa24.11■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.1■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 RIPK4P57078 832 aa24.09■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 FSTL1Q12841 308 aa24.09■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 ERBB4Q15303 1308 aa24.09■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 NPR1P16066 1061 aa24.08■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 SOGA3Q5TF21 947 aa24.08■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.08■■□□□ 1.45
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.08■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.06■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 WDR90Q96KV7 1748 aa24.06■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.05■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.05■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 NGEFQ8N5V2 710 aa24.05■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 MYL6BP14649 208 aa24.04■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 ERFEQ4G0M1 354 aa24.04■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.04■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 FAM177BA6PVY3 158 aa24.03■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 NYXQ9GZU5 481 aa24.03■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.02■■□□□ 1.44
CTIF-206ENST00000588345 POTECB2RU33 542 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 PDIA6Q15084 440 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 CRY2Q49AN0 593 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 CCDC93Q567U6 631 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 ABCC12Q96J65 1359 aa24.01■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 ALDH1B1P30837 517 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 RUNDC1Q96C34 613 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 GPTP24298 496 aa23.97■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 33.9
CTIF-206ENST00000588345 SNED1Q8TER0 1413 aa23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 CHL1O00533 1208 aa23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 SUSD4Q5VX71 490 aa23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.96■■□□□ 1.43
CTIF-206ENST00000588345 NTSR2O95665 410 aa23.95■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.95■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.95■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 NEUROD2Q15784 382 aa23.94■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 PROSER3Q2NL68 480 aa23.94■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 PARP10Q53GL7 1025 aa23.94■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 OLFM4Q6UX06 510 aa23.93■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.93■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 ANXA1P04083 346 aa23.92■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 HTRA3P83110 453 aa23.92■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.92■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms