RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586199.5

ESRRG-223, Transcript of estrogen related receptor gamma, human

TSL 5

Gene ESRRG, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ESRRG-223	ENST00000586199	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	EYA1	Q99502	592 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	SEMA3E	O15041	775 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ESRRG-223	ENST00000586199	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	CYP27B1	O15528	508 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	KCNQ4	P56696	695 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	SMAP	O00193	183 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	BCAM	P50895	628 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	PHKG2	P15735	406 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ESRRG-223	ENST00000586199	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PIGB	Q92521	554 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PADI6	Q6TGC4	694 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	TATDN2	Q93075	761 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	LY75	O60449	1722 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	NBPF26	B4DH59	902 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	POLD1	P28340	1107 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	MTHFS	P49914	203 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	ARX	Q96QS3	562 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	AK7	Q96M32	723 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	IL13	P35225	146 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	SIK1	P57059	783 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	TTC13	Q8NBP0	860 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	C5	P01031	1676 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ESRRG-223	ENST00000586199	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	CABP4	P57796	275 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	PTGDR	Q13258	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	KDR	P35968	1356 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	HMOX1	P09601	288 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	ITGB4	P16144	1822 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	GNPAT	O15228	680 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	YY1	P25490	414 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ESRRG-223	ENST00000586199	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.74	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms