RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-205	ENST00000586027	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GIPC1-205	ENST00000586027	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		40.32	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	HLF	Q16534	295 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	PTGER2	P43116	358 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	SPON1	Q9HCB6	807 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		40.29	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		40.28	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GIPC1-205	ENST00000586027	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF428	Q96B54	188 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	MMP10	P09238	476 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	TM4SF1	P30408	202 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	NFIX	Q14938	502 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	RGL2	O15211	777 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	DDR1	Q08345	913 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	FLII	Q13045	1269 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		40.21	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		40.21	■■■■■ 4.03
GIPC1-205	ENST00000586027	CACNA1F	O60840	1977 aa		40.19	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	NUP98	P52948	1817 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	POLD1	P28340	1107 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	ADCY9	O60503	1353 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	ATP10D	Q9P241	1426 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	LRP5	O75197	1615 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		40.14	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	40.14	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		40.14	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		40.13	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		40.13	■■■■■ 4.02
GIPC1-205	ENST00000586027	GPT	P24298	496 aa		40.12	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	KSR2	Q6VAB6	950 aa		40.12	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		40.12	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	SETDB2	Q96T68	719 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	TCIRG1	Q13488	830 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	BCAR3	O75815	825 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	SERPINB2	P05120	415 aa		40.08	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
GIPC1-205	ENST00000586027	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		40.07	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027		F6X3S4	739 aa		40.06	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		40.06	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	40.06	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		40.06	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	MYD88	Q99836	296 aa		40.05	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		40.05	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		40.03	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM177B	A6PVY3	158 aa		40.03	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	SUSD4	Q5VX71	490 aa		40.02	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	NLRP10	Q86W26	655 aa		40.02	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		40.02	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	PTPRC	P08575	1304 aa		40.01	■■■■■ 4
GIPC1-205	ENST00000586027	IGKV5-2	P06315	115 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	PARP10	Q53GL7	1025 aa		39.98	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	NTSR2	O95665	410 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	KIF16B	Q96L93	1317 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	CNBD1	Q8NA66	436 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	39.95	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	KLHL34	Q8N239	644 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
GIPC1-205	ENST00000586027	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	39.94	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		39.94	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	BEND3	Q5T5X7	828 aa		39.92	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		39.92	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	39.92	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	39.92	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	NYX	Q9GZU5	481 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GIPC1-205	ENST00000586027	TNN	Q9UQP3	1299 aa		39.91	■■■■□ 3.98

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