RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARHGEF10O15013 1369 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB7AO95365 584 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 RFC5P40937 340 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 PSME1Q06323 249 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSC1Q92574 1164 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLRG1Q96E93 195 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 CFAP99D6REC4 459 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 AP1G2O75843 785 aa7.32□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNS2Q63HR2 1409 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 DESI1Q6ICB0 168 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATP10DQ9P241 1426 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 S1PR4O95977 384 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 JUNDP17535 347 aa7.3□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 VPS72Q15906 364 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 DISP2A7MBM2 1401 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 MMP16P51512 607 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 HTRA3P83110 453 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 LYPD8Q6UX82 237 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 BANK1Q8NDB2 785 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC8-202ENST00000577426 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC8-202ENST00000577426 AKAP12Q02952 1782 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF223E7ERA6 249 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTPRNQ16849 979 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ACEP12821 1306 aa7.26□□□□□ -1.25
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ARXQ96QS3 562 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIK3C2AO00443 1686 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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TRAPPC8-202ENST00000577426 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.24□□□□□ -1.25
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TRAPPC8-202ENST00000577426 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 COL18A1P39060 1754 aa7.23□□□□□ -1.25
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TRAPPC8-202ENST00000577426 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLIT3O75094 1523 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNRKQ9NRH2 765 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP19O94966 1318 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHD4Q14839 1912 aa7.23□□□□□ -1.25
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